(Logiciel) UniProt

UniProt est une base de données de séquences de protéines. C’est une base de données ouverte, stable et accessible en ligne, elle est issue de la consolidation de l’ensemble des données produites par la communauté scientifique.
Uniprot permet entre autres, de comparer des séquences de bases nucléotidiques afin de mettre en évidence des mutations et donc, des versions alléliques différentes d’un même gène.

Proposition d’une piste pédagogique (par Fabien S.) :
Dans les années 30, le chimiste Arthur Fox synthétise le composé PTC (PhénylThioCarbamide), un composé amer produit entre autres par le brocoli.
L’un de ses collègues se plaint de l’amertume du produit alors que lui-même ne sent rien. Il est ainsi le premier à mettre en évidence la différence de sensibilité au PTC au sein de la population.
C’est en 2003 seulement que le gène TAS2R38 codant pour le récepteur au PTC situé sur la langue a été identifié.

Vous disposez des séquences ADN du gène TAS2R38 d’un individu insensible au PTC et d’un individu sensible au PTC.

>geneTAS2R38personneninsensible
atgttgactc taactcgcat ccgcactgtg tcctatgaag tcaggagtac atttctgttt
atttcagtcc tggagtttgc agtggggttt ctgaccaatg ccttcgtttt cttggtgaat
ttttgggatg tagtgaagag gcaggcactg agcaacagtg attgtgtgct gctgtgtctc
agcatcagcc ggcttttcct gcatggactg ctgttcctga gtgctatcca gcttacccac
ttccagaagt tgagtgaacc actgaaccac agctaccaag ccatcatcat gctatggatg
attgcaaacc aagccaacct ctggcttgct gcctgcctca gcctgcttta ctgctccaag
ctcatccgtt tctctcacac cttcctgatc tgcttggcaa gctgggtctc caggaagatc
tcccagatgc tcctgggtat tattctttgc tcctgcatct gcactgtcct ctgtgtttgg
tgctttttta gcagacctca cttcacagtc acaactgtgc tattcatgaa taacaataca
aggctcaact ggcagaataa agatctcaat ttattttatt cctttctctt ctgctatctg
tggtctgtgc ctcctttcct attgtttctg gtttcttctg ggatgctgac tgtctccctg
ggaaggcaca tgaggacaat gaaggtctat accagaaact ctcgtgaccc cagcctggag
gcccacatta aagccctcaa gtctcttgtc tcctttttct gcttctttgt gatatcatcc
tgtgttgcct tcatctctgt gcccctactg attctgtggc gcgacaaaat aggggtgatg
gtttgtgttg ggataatggc agcttgtccc tctgggcatg cagccatcct gatctcaggc
aatgccaagt tgaggagagc tgtgatgacc attctgctct gggctcagag cagcctgaag
gtaagagccg accacaaggc agattcccgg acactgtgtt ga

>geneTAS2R38personnesensible
atgttgactc taactcgcat ccgcactgtg tcctatgaag tcaggagtac atttctgttc
atttcagtcc tggagtttgc agtggggttt ctgaccaatg ccttcgtttt cttggtgaat
ttttgggatg tagtgaagag gcagccactg agcaacagtg attgtgtgct gctgtgtctc
agcatcagcc ggcttttcct gcatggactg ctgttcctga gtgctatcca gcttacccac
ttccagaagt tgagtgaacc actgaaccac agctaccaag ccatcatcat gctatggatg
attgcaaacc aagccaacct ctggcttgct gcctgcctca gcctgcttta ctgctccaag
ctcatccgtt tctctcacac cttcctgatc tgcttggcaa gctgggtctc caggaagatc
tcccagatgc tcctgggtat tattctttgc tcctgcatct gcactgtcct ctgtgtttgg
tgctttttta gcagacctca cttcacagtc acaactgtgc tattcatgaa taacaataca
aggctcaact ggcagaataa agatctcaat ttattttatt cctttctctt ctgctatctg
tggtctgtgc ctcctttcct attgtttctg gtttcttctg ggatgctgac tgtctccctg
ggaaggcaca tgaggacaat gaaggtctat accagaaact ctcgtgaccc cagcctggag
gcccacatta aagccctcaa gtctcttgtc tcctttttct gcttctttgt gatatcatcc
tgtgctgcct tcatctctgt gcccctactg attctgtggc gcgacaaaat aggggtgatg
gtttgtgttg ggataatggc agcttgtccc tctgggcatg cagccgtcct gatctcaggc
aatgccaagt tgaggagagc tgtgatgacc attctgctct gggctcagag cagcctgaag
gtcagagccg accacaaggc agattcccgg acactgtgct ga