(Modélisation) Logiciel NetBioDyn

NetBioDyn est un logiciel open-source permettant de modéliser et simuler de nombreux mécanismes biologiques et physiques.
Il s’adresse aux élèves du secondaire et aux étudiants du supérieur.
Aucun notion de programmation n’est requise.
Il fonctionne sous tous les systèmes ayant Java (Linux, Mac, Windows, etc).

Remarque : les problèmes de dysfonctionnement du logiciel (pas de visibilité de l’interface netBioDyn à l’ouverture du logiciel, ou gel du logiciel lors de son utilisation) sont généralement résolus par une mise à jour du programme Java .

Télécharger le logiciel :
- Kit contenant l’exécutable du logiciel NetBioDyn
- Utilisation en ligne, Université de Brest
- (Utilisation hors ligne) : Télécharger le logiciel (NetBioDyn version 2018) à partir de l’Université de Brest

Tutoriel :
- Tutoriel : construire un modèle avec NetBioDyn (Pdf)
- Tutoriel : Faire tourner un modèle avec NetBioDyn (Pdf)

Ressources netBioDyn :
- Accès au téléchargement des modèles netBioDyn en immunologie au collège et au lycée

Exemples de modélisation avec NetBioDyn :
- Pédagogie inversée autour de la réaction inflammatoire aiguë
Modèle scientifique versus modèle numérique

- Modéliser une étude de l’INRA montrant l’influence des fibres alimentaires sur la composition du microbiote
- Modélisation d’une stratégie vaccinale : l’exemple de la rougeole
- Un modèle de microbiote intestinal (cycle 4)
- Un modèle pour la lecture et interprétation d’un antibiogramme (cycle 4)

Vidéo tutoriel de modélisation :

Tutoriel BioDyn : prolifération de bactéries (6’08)

Tutoriel netBioDyn : propagation d’une épidémie (7’55)